Hoolimata asjaolust, et paavst Franciscus mõjutab katoliku kirikut väga soodsalt, ei olnud tema ajaloos mitte ainult valgeid, vaid ka mustad triibud. Siin on kümme Vatikanis puhkenud skandaali, mis ulatuvad salajastest materjalidest kuni surnukeha kohtuprotsessini.
- Johannes XII valiti Püha Tooli pärijaks 18-aastaselt. Peagi müristas tema nimi kogu maailmas: noor pontiff äratas rohkem kui üks kord avalikkuse tähelepanu isikliku elu tõttu, mis teda palju rohkem huvitas kui kiriku asjaajamine. Johni vastu esitatud süüdistuste loend sisaldas klauslit, mis näitas, et noor paavst kutsus kohale deemonid, tappis ja piinas inimesi ning mängis sageli ka hasartmänge. Mõned ajaloolased väidavad, et Johannes XII-l oli abielus daamidega palju intriige. Tema paavstlus lõppes aastal 964, kui ta suri infarkti, veetes väidetavalt aega ühe oma armukese juures.
- Näib, et 1470. aastatel “küpses” paavst Sixtus IV kõikjal. Tal oli kuus illegaalset last, kellest üks sündis suhte tõttu õega. Väärib märkimist, et pontifil olid oma põhimõtted. Ta tõi kirikusse palju raha, kogudes prostituutidelt makse. Pealegi Sixtus IV käskis preestritel armukeste õiguse eest maksta raha. Kuid paavst suutis oma nime ajalukku kirjutada mitte ainult oma kirgliku isikliku elu tõttu: Sixtuse kabel (Cappella Sistina) sai nime tema järgi.
- Paavst Stephen VI kirjutas oma raamatus, et kättemaks on eriti armas pärast surma. Võib-olla just seetõttu nõudis ta, et tema eelkäija paavst Formosa surnukeha exhumeeritaks, et ta kohtusse saata. Surnud paavsti surnukeha tunnistati süüdi paljudes kuritegudes, sealhulgas tema komme tutvustada end peapiiskopina pärast seda väärikust taganemist. Paavst Stephenit tabas pärast tema tegu ka raske saatus: ta arreteeriti ja visati vanglasse, kus ta suri 897. aastal.
- Hoolimata katoliku kiriku salajaste dokumentide lekitamisest 2012. aastal, sattusid Vatikani salajased andmed esmakordselt avalikkuse kätte 1869. aastal, kui saksa väljaanne avaldas paavst Pius IX läbirääkimised ametnikega, kus arutas ratsionalismi, liberalismi ja materialismi mõju.
- Üks suuremaid skandaale puhkes Vatikanis 2010. aastal, heites varju Benedictus XVI paavstluse ajal. Neli aastat tagasi said ajakirjanikud teada, et paavsti assistent Angelo Balducci ja Püha Peetri katedraali koori liige Chinedu Thomas Ehiem olid seotud meeste prostitutsiooniskeemiga. Politsei tuvastas Balducci osaluse selles juhtumis Eichemi juhtimisel, kes osales noorte otsesel ametnikul toimetamises. Praegu on uurijad kindlad, et kokku pakkus koorikoor Balduile vähemalt 10 kohtumist noortega, sealhulgas modellimees ja ragbimängija.
- Vatikan seisis 2013. aasta alguses silmitsi tõsiste rahaliste probleemidega, kui Itaalia keskpank lõpetas Vatikanis sularahaautomaatide teenindamise, kuna ametivõimud ei järginud kõiki eeskirju, mille eesmärk on takistada rahapesu. Plastikaartide kasutamise võimetus maksis Vatikanile umbes 3000 eurot päevas kuni 12. veebruarini, mil Šveitsi pank nõustus tagama tühikäigul sularahaautomaatide stabiilse töö.
- 28. juunil 2013 arreteeriti endine raamatupidamisosakonna juhataja Nunzio Sczrano koos kahe kaasosalise, endise spiooni ja finantseerijaga. Teda esitleti salakaubavedu 20 miljonit eurotmida ta vedas eralennukis. Hiljem selgitas ametniku advokaat, et tema palatis keeldutakse oma süüd tunnistamast. See skandaal sundis Vatikani Panga presidendi ja tema asetäitja tagasi astuma.
- 19. juulil 1982 leiti Blackfriarsi sillalt Roberto Calvi surnukeha, tuntud ka kui “Jumala pankur”. Milano Ambrosiano panga esimees (mille peamine aktsionär on Vatikan) süüdistatakse eriti suurte summade ebaseaduslikus ekspordis välismaale. Mees lendas Londonisse, kus ta tapeti, ja sel ajal sai Ameerika peapiiskop, kes oli seotud ka Calvi juhtumiga, puutumatuse.
- Pedofiilias süüdistatav katoliku vaimulik, arreteeriti laimu pärast, kui ta teatas, et Vatikanis õitseb homoprostitutsioon. Patricio Poggi peeti kinni pärast seda, kui uurijad kahtlustasid tema avaldustes valet. Podgy väitis varem, et geide otsimise eest vastutas endine politseiametnik.
- 23. mail 2012 arreteeriti paavst Benedicti “parem käsi” Paolo Gabriele Vatikani konfidentsiaalsete dokumentide edastamise eest Itaalia ajakirjanikule Gianluigi Nuzzile. Ta kiirustas kohe ilmutama korruptsiooni olemasolu Vatikani müüridesja Gabriele karistati varastamise eest. 2012. aasta oktoobris mõisteti talle 18 kuud koduaresti.
